MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natronobacterium gregoryi SP2 chromosome

Total Repeats: 13864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019792	GGT	2	6	6	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019792	GTC	2	6	18	23	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019792	GA	3	6	33	38	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019792	GAA	2	6	80	85	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019792	TC	3	6	133	138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019792	GGTGTC	2	12	177	188	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019792	CAA	2	6	267	272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019792	CGAT	2	8	316	323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019792	TC	3	6	3470	3475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019792	CGTC	2	8	3495	3502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019792	ATT	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019792	TCG	2	6	3529	3534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019792	CAG	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019792	GTG	2	6	3642	3647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019792	TTG	2	6	3671	3676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019792	GTC	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019792	TCGA	2	8	3697	3704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019792	CTT	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019792	CGC	2	6	3787	3792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019792	CTCTC	2	10	3810	3819	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_019792	GGC	2	6	5071	5076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019792	ATT	2	6	5125	5130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019792	CGA	2	6	5183	5188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019792	AGT	2	6	5202	5207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019792	GTC	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019792	CGT	2	6	6227	6232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019792	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019792	TCC	2	6	6330	6335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019792	TCG	2	6	7431	7436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019792	TC	3	6	8635	8640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019792	TCGC	2	8	8645	8652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019792	CGACC	2	10	8666	8675	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_019792	CGT	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019792	AG	3	6	8795	8800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019792	GACC	2	8	8895	8902	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019792	GCC	2	6	10759	10764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019792	CCCGC	2	10	10784	10793	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_019792	GA	3	6	11761	11766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019792	CTA	2	6	13263	13268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019792	GCC	2	6	16992	16997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019792	CGT	2	6	17009	17014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019792	ACTC	2	8	17115	17122	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019792	GATG	2	8	17266	17273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019792	GC	3	6	17564	17569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019792	TC	3	6	17611	17616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019792	CCG	2	6	17632	17637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019792	CGC	2	6	17640	17645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019792	CTGG	2	8	17724	17731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019792	ATT	2	6	17825	17830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019792	GCC	2	6	19787	19792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019792	TTTC	2	8	19820	19827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019792	GA	3	6	20034	20039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019792	GAC	2	6	20097	20102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019792	AGC	2	6	20199	20204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019792	TTG	2	6	20302	20307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019792	CAG	2	6	20318	20323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019792	GT	3	6	20327	20332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019792	TCC	2	6	20381	20386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019792	CCAG	2	8	20389	20396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019792	CTCGA	2	10	20446	20455	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_019792	C	6	6	20467	20472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_019792	GGC	2	6	20519	20524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019792	TCGA	2	8	20550	20557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019792	GGT	2	6	20617	20622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019792	CTTCG	2	10	20698	20707	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019792	TCG	2	6	20773	20778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019792	CTC	2	6	20833	20838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019792	TCGT	2	8	20896	20903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019792	CTC	2	6	20931	20936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019792	GTC	2	6	21008	21013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019792	CAC	2	6	21117	21122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_019792	CTTA	2	8	21159	21166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019792	TC	3	6	22691	22696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019792	GATC	2	8	22718	22725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019792	ATTT	2	8	22860	22867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019792	AT	3	6	22964	22969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019792	CCT	2	6	23240	23245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019792	GAAAC	2	10	23256	23265	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019792	GCA	3	9	23407	23415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019792	TA	3	6	23551	23556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019792	CTGA	2	8	23557	23564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019792	CTT	2	6	23578	23583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019792	CAT	2	6	23643	23648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019792	GCG	3	9	25629	25637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019792	ATTCT	2	10	25689	25698	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019792	AT	3	6	25722	25727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019792	ATT	2	6	25756	25761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019792	TGCC	2	8	25770	25777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019792	GTC	2	6	25914	25919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019792	GCA	2	6	25929	25934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019792	TCA	2	6	26013	26018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019792	GGT	2	6	26057	26062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019792	GTA	2	6	26100	26105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019792	GCT	2	6	26219	26224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019792	GAC	2	6	26229	26234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019792	GTCGG	2	10	26277	26286	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019792	GCT	2	6	26310	26315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019792	CTG	2	6	26335	26340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019792	TAC	2	6	26376	26381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019792	GCTT	2	8	26417	26424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019792	GAC	2	6	26488	26493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019792	AG	3	6	26501	26506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019792	CAA	2	6	28167	28172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019792	TCG	2	6	30823	30828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019792	CCG	2	6	30902	30907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_019792	ACCG	2	8	30940	30947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019792	ATT	2	6	33825	33830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019792	GTC	2	6	34723	34728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019792	CGG	2	6	34794	34799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019792	TGCGTG	2	12	34817	34828	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_019792	GTC	2	6	34846	34851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019792	CTCG	2	8	34879	34886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019792	CGT	2	6	34908	34913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019792	TCC	2	6	34924	34929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_019792	GCC	2	6	34940	34945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019792	CGAT	2	8	34976	34983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019792	GTC	3	9	35008	35016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019792	GCG	2	6	35026	35031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019792	GCC	2	6	35050	35055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019792	GTC	2	6	35099	35104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019792	CGC	2	6	35127	35132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_019792	GGAAC	2	10	35175	35184	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019792	A	7	7	35195	35201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019792	CGT	2	6	35222	35227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019792	CGG	2	6	36318	36323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019792	CCT	2	6	37388	37393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_019792	CTG	2	6	38491	38496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019792	TTG	2	6	38563	38568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019792	ACTG	2	8	38629	38636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019792	CGT	2	6	38688	38693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019792	CGA	2	6	38721	38726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019792	CGGC	2	8	39003	39010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019792	T	6	6	40126	40131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019792	CGC	2	6	40197	40202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019792	GTG	2	6	40217	40222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019792	CGT	2	6	41338	41343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019792	TCGGCG	2	12	41353	41364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019792	TTC	2	6	41367	41372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019792	CGGA	2	8	41394	41401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019792	AGT	2	6	41411	41416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019792	AGT	2	6	41424	41429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019792	CTA	2	6	41442	41447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019792	TCT	2	6	41495	41500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019792	CGCC	2	8	41545	41552	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_019792	CGC	2	6	41684	41689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_019792	TCG	3	9	41729	41737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019792	TGG	2	6	41773	41778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_019792	GTC	2	6	41977	41982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019792	CTG	2	6	42007	42012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_019792	CT	3	6	49072	49077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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444	NC_019792	CGA	2	6	108640	108645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_019792	GAG	2	6	108851	108856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_019792	TCG	2	6	108894	108899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_019792	GCG	2	6	108903	108908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_019792	TCGAA	2	10	108951	108960	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
456	NC_019792	GTC	2	6	108992	108997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_019792	CGG	2	6	109008	109013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_019792	TGC	2	6	109024	109029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_019792	CGC	2	6	109120	109125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_019792	CTG	2	6	109208	109213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_019792	GCT	2	6	109253	109258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_019792	CGAGGA	2	12	109264	109275	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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467	NC_019792	TCG	3	9	109347	109355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_019792	GAG	2	6	109361	109366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
469	NC_019792	CGC	2	6	109395	109400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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482	NC_019792	ATC	2	6	116372	116377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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